北京交通大學是教育部直屬高校，已有120年的辦學歷史，1981年成為全國首批博士、碩士學位授予單位，1994年首批進入“211工程”建設，2004年批準設立研究生院，是我國現有56所研究生院單位之一。我校牽頭的“2011計劃”“軌道交通安全協同創新中心”是國家首批認定的14個協同創新中心之一。
自1978年我國恢復研究生招生、1981年實施學位制度以來，我校研究生教育工作在規模和質量上都取得了明顯進步，已畢業研究生33782人。1999年榮獲“全國學位與研究生教育管理工作先進集體”稱號；2008年成為全國研究生培養機制改革試點高校之一；2009年被設立為北京高校產學研聯合研究生培養基地；2010年被評為全國工程碩士研究生教育創新院校；2014年我校與長春軌道客車股份有限公司聯合申報的“軌道交通專業學位研究生聯合培養實踐基地”獲第一屆“全國示范性工程專業學位研究生聯合培養基地”榮譽稱號。
北京交通大學有一級學科博士學位授權點21個，一級學科碩士學位授權點35個，有12類專業學位授權，其中工程碩士專業學位在21個工程領域招收培養研究生。各學科在人才培養和科學研究上具有較強的實力，現有2個一級學科國家級重點學科，2個二級學科國家級重點學科，5個一級學科省部級重點學科，9個二級學科省部級重點學科，2個交叉學科省部級重點學科。現有博士生導師575人，碩士生導師721人，其中國務院學科評議組成員6人。目前在學博士研究生2772人，全日制碩士研究生7910人，在職專業學位研究生5871人。
在研究生教育中，我校研究生院不斷進行研究生教育的改革與探索，始終堅持把培養質量放在首位，嚴格把握各個培養環節和學位授予質量，自2002年起逐步完善研究生培養質量保證體系，采取了博士、碩士學位論文匿名評審、學位論文抽查等措施。2004年起實施研究生教育創新工程，研究生培養質量逐年提高，已有5人獲得全國優秀博士學位論文，14人獲得全國優秀博士論文提名。在2014年設立的中國學位與研究生教育學會研究生教育成果獎評選中，獲二等獎一項。2016年，2人獲得中國電子學會年度優秀博士學位論文，1人獲提名。
北京交通大學研究生院十分重視開展國際交流與合作，與多個國家和地區高校建立了校際合作和交流關系，開展學術交流、聯合培養研究生等工作，同時面向港、澳、臺地區和其他國家招收碩士、博士研究生，2009年成為國家建設高水平大學公派研究生項目簽約高校之一。
在當前研究生教育發展的新形勢下，研究生院將圍繞調整結構、注重創新、提高質量的發展思路，進一步加大優秀拔尖人才培養力度，扎實工作，努力開創北京交通大學學位與研究生教育的新局面。